Leguáni jsou po narození úplně stejní, tzn., že nelze rozeznat na první pohled samička od samce. Během dospívání se začnou projevovat odlišnosti, které můžeme pozorovat i my pouhým okem. Jednotlivá pohlaví lze od sebe rozeznat pomocí druhotných pohlavních znaků = pohlavního dimorfismu.
Bezpečně můžeme rozeznat samce od samičky leguána již kolem druhého roku života, pokud se leguán vyvíjí, jak má.
Někdy je určení pohlaví složité i u několikaletého jedince, např. samci chování ve skupině s dalšími samci se mohou vyvíjet navenek jako samice, což je chování, které známe i z přírody. V tamních skupinách je to velice běžné.
Samečci
- Světlá hlava a oranžové přední končetiny.
- Velký hrdelní lalok.
- Hřbetní hřeben z kožních ostnů (táhne se po celé délce jeho těla). Pozor na to, že ho může mít vyvinutý i samice.
- Na lících pod ušním otvorem má perleťově zbarvenou velkou šupinu, obklopenou několika menšími.
- U pohlavně dospělých samců jsou u kořene ocasu dobře viditelná pouzdra pro hemipenisy, které mají dva.
Pohlaví u mladých zvířat se dá zjistit sondou.
Hlavní rozlišovací pohlavní znaky:
- stehenní póry - nacházejí se na vnitřní straně stehen a táhnou se v řadě směrem k ocasu k holeni.
- kořen ocasu - samci mají v kořeni ocasy umístěny hemipenisové kapse s hemipenisy, což jsou dvě podélné boule, umístěny směrem od kloaky ke konci ocasu. U dospívajích samců jsou jasně zřetelné.
- ostny - samci mívají delší hřbetní řadu ostnů, zvláště za krkem dorůstají samcům ostny mnohem delší
- hlava - samci mívají protáhlejší a masivnější hlavu, více vyvinuté lícní šupiny a lícní vaky (u dospělých jedinců nafouklé) a větší lalok